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Taqman실험은 MIQE 지침에 부합하는가? - Ask TaqMan #19

240 views · Published 29 August 2013 · 3:44 · Indexed 18 October 2026

Channel: Thermo Fisher Scientific · 2013 · Science & Technology

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실시간 PCR에 대한 여러분의 질문에 답해드리는 'TaqMan에게 물어봐'입니다. qPCR를 사용하는 연구자 중에는 실험적 설계와 데이터 보고 실무가 MIQE 지침의 표준에 부합하는지 확인하는 것을 중요하게 생각합니다. 구체적으로 사용자들은 라이프 테크놀로지스가 이전에 개발한 TaqMan assay가 MIQE 권고사항에 부합하는지 궁금해 합니다. 저는 오늘 여러분께 그렇다는 것을 설명하며 라이프 테크놀로지스의 qPCR assay가 어떻게 여러분을 돕는지 말씀드리겠습니다. 
MIQE는 정량 실시간 PCR 실험의 최소 정보 (Minimum Information for Publication of Quantitative Real-Time PCR Experiments) 의 약자로 원래 2009년에 발표되었고 2011년에 조금 개정되었습니다. MIQE 저자들은 qPCR 실험 설계와 분석, 이 정보를 동료와 공유하기 위한 기준 등   모든 측면에 대한 지침을 제안합니다. 
그럼 라이프 테크놀로지스가 사전 개발한 qPCR assay는 어떻게 설계나 정보 공유 면에서 실험실이 MIQE 권고안에 부합할 수 있도록 도왔을까요? 제가 답변해 드리지요.
라이프 테크놀로지스의 TaqMan Assay 보장 프로그램 백서에 설명되어 있듯이 라이프 테크놀로지스의 백만여 개 qPCR assay는 첨단 생물정보학 파이프라인을 사용하여 설계되어 있어 최대의 증폭 효율과 최적화가 필요없는 표준화된 작동 조건, 그리고 가장 중요하게 표적 특이성을 보장합니다. 이런 설계 과정에서 고품질 RefSeq 컨텍스트 시퀀스에 오랜 기간 수립되어 있는 설계 알고리즘을 사용한 엄격한 생물정보 조사를 실시하고 있습니다. 이 과정을 통해 유사유전자과 동족체를 증폭하지 않으며 알고 있는 다형성 부위와 단순반복 시퀀스를 피하는 유전자 중심의 분석법을 만들었습니다. 또한 라이프 테크놀로지스는 NCBI 데이터베이스 개정에 따라 정기적으로 리맵핑을 수행하여 assay와 관련 정보를 최신으로 유지합니다.
연구자가 본사 웹사이트에서 assay를 검색하면 NCBI 유전자 ID, 유전자 기호, 분석 별로 조사된 RefSeq ID 목록, RNA 고유 번호 등 많은 유용한 정보를 이용할 수 있습니다. 우리는 특정 올리고 시퀀스를 공유하진 않지만 컨텍스트 시퀀스와 프로브 위치, 그리고 해당된다면 해당 assay가 지나는 엑손-엑손 경계를 제공합니다. 마지막으로 사용자는 주어진 유전자에 대한 모든 분석물이 어떻게 연결되는지를 모든 전사와 함께 맵에서 한 눈에 볼 수 있습니다. 
즉, 라이프 테크놀로지스는 실험적 요구와 MIQE에 부합하는 올바른 분석 선택에 필요한 모든 정보를 제공합니다. 무엇보다도 TaqMan Assay는 지금까지 수 년간 제공되며 5천여 논문에서 인용되고 있습니다.
여러분의 필요에 맞는 TaqMan Assay를 검색하고 선택하는 방법에 대해 더 알고 싶다면 이 주제에 대한 TaqMan에게 물어봐 동영상을 보시기 바랍니다.

실시간 PCR에 대해 질문이 있으세요? TaqMan®에게 물어보세요. #askTaqman으로 트위터하거나 페이스북으로 찾아보세요. 아니면 http://lifetechnologies.com/askTaqMan 웹사이트로 오셔도 됩니다.

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